乾隆准备修订《四库全书》时，纪晓岚成为总印官。和珅自然很不服气，于是将与纪晓岚有私人恩怨的颜如玉安插在纪晓岚身边，伺机报复。为了招揽人才，乾隆不得不开设恩科考试。和珅热烈响应，认为既能聚敛钱财，又能广收弟子。但纪晓岚大加反对，招致惩罚。因科举考试舞弊成风，考生刘金心大闹科举。乾隆得知后大怒，命和珅调查此事。和珅舍身护车，严厉追究考试人员，但考试作弊的真正操纵者总督敏德并未参与其中。刘锦心因揭露考场丑闻而受到敏德的迫害，纪晓岚决定查明原相。纪晓岚在与和珅的一次较量后，愤怒地揭露了科举考试的弊端。

《铁齿铜牙纪晓岚》第二部到达了一个巅峰，尤其是在故事情节上和人物的表演上。印象最深的是最后一个故事林永健演的卢卓，承接了第一部，把人物的关系进一步发展，老纪、和二、黄三的铁三角架构基本形成。在中国可以拍出这样一部脍炙人口，陪伴我们童年的，带给我们欢笑的系列剧并不容易。这个古老的故事已经结束了，一切的一切都回不去了，只能把这曾经的嬉笑怒骂珍藏在记忆中了。